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光敏性sgRNA调控Cas9蛋白的失活
2021-04-08 17:03:31

  对CRISPR-Cas9技术的精确调控可以提高其在基因编辑方面的安全性和适用性,然而这一目标目前却仍受 “不完全失活” 、 “速率过慢” 等缺点的限制。为了克服这些障碍,在最近一项研究中,来自约翰霍普金斯大学的Taekjip Ha教授等人设计了光敏感、可裂解的guide RNA(pcRNA),从而能够利用光照达到降解sgRNA分子,进而调控Cas9核酸酶基因编辑活性的目的。相关结果发表在最近的《Molecular Cell》杂志上。



  首先,作者在gRNA分子中插入了光敏可切割基团,构建出了pcRNA分子,进而在体外实验中验证了该修饰后的sgRNA是否受光照的调节。实验结果表明,在缺乏光照的情况下,pcRNA与cas9混合物能够高效地切割DNA底物。相反地,在接受350nm光照的情况下,DNA分子则几乎没有受到切割。光照30s就足以达到灭活sgDNA-cas9复合体活性的目的。此外,作者还证明了pcRNA分子同时能够兼容其它类型的CRISPC-cas9平台,例如单核酸碱基编辑。在转染了AncBE4max以及pcRNA分子的HEK293T细胞中,光照2分钟就足以起到灭活单碱基编辑活性的效果。

  众所周知,脱靶现象是基因组编辑技术中的难题,为了探究光敏基团修饰能否提高sgRNA-cas9靶向编辑的特异性,作者检测了基因组中VEGFA2以及HEK4等脱靶位点的胞嘧啶突变效应。结果显示,在共转染pcRNA与cas9/AncBE4max的HEK293T细胞中,脱靶位点的基因突变几率明显降低。与野生型sgRNA相比,光敏可切割的pcRNA的中靶/脱靶比例升高了2-9000倍。为了了解其背后的分子机制,作者通过体外切割实验检测了cas9/pcRNA的切割动力学特征。结果表明,在所有接受检测的靶向序列中,pcRNA的初始切割速率相比传统sgRNA明显更慢,但最终的切割速率达到相当的水平。此外,在sgRNA序列与靶向序列存在差异的情况下,传统的sgRNA仍旧能够介导高速率的切割,而pcRNA的切割速率明显更慢。这些结果表明pcRNA相比传统sgRNA具有更低的脱靶率。

  之后,作者研究了pcRNA-Cas9达到有效切割活性时所需的最低时间,作者进行了系统的动力学分析并且绘制了时间曲线。结果表明,尽管因序列差异存在较高的异质性,但对于AncBEmax而言最低时间仅需4小时,而Cas9则需要36小时。

  综上,作者通过设计一种新型的“光敏性,可切割”版本的sgRNA——“pcRNA”,证明其具有相比传统sgRNA更高的特异性,更低的脱靶性以及充分的切割速率,该研究或许有助于进一步提高CRISPR-cas9基因编辑技术的潜力。

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